277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1819 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  45.75 
 
 		 254 aa  225  6e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  47.93 
 
 		 247 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  45.09 
 
 		 247 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  44.64 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  45.19 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  37.6 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  34.98 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  35.56 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  37.72 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  35.43 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  35.24 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  34.6 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  34.6 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  33.6 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  33.04 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  35.46 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  33.9 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  33.9 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  30.6 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  30.6 
 
 		 252 aa  128  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  33.92 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  31.63 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  36.05 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  31.02 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  36.57 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  36.14 
 
 		 273 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  32.16 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  30.6 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 		 275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.25 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  31.08 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  31.08 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  32.53 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  34.29 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  33.12 
 
 		 211 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 		 248 aa  101  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  35.53 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  36.81 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  33.33 
 
 		 211 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  35.53 
 
 		 217 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 262 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  29.64 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  29.22 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 		 211 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  33.11 
 
 		 210 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.06 
 
 		 204 aa  92.4  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.06 
 
 		 204 aa  92.4  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  27.95 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 205 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  30.82 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  32.89 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  30.25 
 
 		 204 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  28.78 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  28.79 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  30.22 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  30.53 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04861  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  30.53 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  30.53 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  25.21 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  30 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  29.45 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  28.3 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  30 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  28.3 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7384  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 		 535 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0030  hypothetical protein  28.29 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.619375  normal  0.116202 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  27.19 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  27.31 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 		 235 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  27.31 
 
 		 294 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  26.64 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001108  secreted protein suppressor for copper-sensitivity ScsC  27.67 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.269986  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  25.85 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 307 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>