225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2570 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
245 aa  494  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  39.57 
 
 
260 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  39.71 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  39.71 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  35.59 
 
 
243 aa  136  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  35.59 
 
 
243 aa  136  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.81 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  37.4 
 
 
266 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  37.24 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  34.65 
 
 
252 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  32.38 
 
 
254 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 
259 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  35.9 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  35.32 
 
 
252 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 
255 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  34.11 
 
 
255 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  35.64 
 
 
265 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  43.5 
 
 
236 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  33.78 
 
 
254 aa  122  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  35.64 
 
 
265 aa  122  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  33.95 
 
 
255 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  36.63 
 
 
268 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  33.2 
 
 
255 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  37.8 
 
 
247 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  39.6 
 
 
209 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 
250 aa  118  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  37.63 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  33.04 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  38.04 
 
 
261 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  38.04 
 
 
261 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  33.64 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 
255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 
255 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 
248 aa  112  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 
247 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  34.5 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  31.73 
 
 
274 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  43.11 
 
 
222 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  42.55 
 
 
205 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  33.85 
 
 
247 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  41.83 
 
 
233 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  42.25 
 
 
211 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  39.74 
 
 
217 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  38.36 
 
 
198 aa  99.4  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  34.5 
 
 
238 aa  99.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  35.19 
 
 
281 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  34.45 
 
 
250 aa  99  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  38.67 
 
 
265 aa  97.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  30.89 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  30.43 
 
 
246 aa  95.9  5e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  35.16 
 
 
253 aa  95.9  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  36.05 
 
 
211 aa  95.5  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  35.85 
 
 
204 aa  95.1  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  35.66 
 
 
204 aa  92.8  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  37.59 
 
 
197 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  35.66 
 
 
204 aa  92.8  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0030  hypothetical protein  33.62 
 
 
281 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.619375  normal  0.116202 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  28.23 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 
262 aa  89.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  37.33 
 
 
211 aa  89  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 
209 aa  89  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  34.66 
 
 
211 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  37.82 
 
 
349 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 
210 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  35 
 
 
210 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  38.61 
 
 
348 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
210 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  28.35 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  38.61 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  31.45 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  32.95 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  34 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  25.31 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 
354 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
535 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  31.94 
 
 
226 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  30.38 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  31.91 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  31.91 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  31.21 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.79 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  31.21 
 
 
207 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  25.96 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 
293 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  31.69 
 
 
671 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  31.69 
 
 
671 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  24.26 
 
 
294 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>