245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1210 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  100 
 
 		 207 aa  427  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  100 
 
 		 207 aa  427  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  99.52 
 
 		 207 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  99.03 
 
 		 207 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  99.03 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  50.21 
 
 		 238 aa  241  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  35.09 
 
 		 274 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  36 
 
 		 270 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  35.88 
 
 		 294 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001108  secreted protein suppressor for copper-sensitivity ScsC  36.14 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.269986  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1379  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.71 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  36.52 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 294 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04861  hypothetical protein  34.13 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  37.06 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  32.93 
 
 		 252 aa  95.1  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  32.93 
 
 		 252 aa  95.1  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  31.03 
 
 		 265 aa  94.7  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  31.03 
 
 		 265 aa  94.7  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  32.39 
 
 		 255 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0760  putative suppressor for copper-sensitivity C precursor  40.95 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 255 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  33.9 
 
 		 255 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  31.14 
 
 		 252 aa  91.3  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  27.08 
 
 		 266 aa  91.3  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  37.2 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  31.14 
 
 		 252 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  31.77 
 
 		 268 aa  88.6  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 		 243 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 		 243 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  33.71 
 
 		 255 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  30.3 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  34.08 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  35.96 
 
 		 254 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 260 aa  85.9  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  30.3 
 
 		 246 aa  85.5  5e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  32.07 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  28.48 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  29.48 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  30.63 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  24.89 
 
 		 259 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  26.14 
 
 		 265 aa  81.3  0.000000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  29.08 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.34 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  24.89 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  32.05 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  26 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  30.12 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  30.93 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  30.61 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  30.23 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  25.76 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  28.34 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  31.64 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  29.82 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  29.07 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  27.11 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  27.06 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  28.82 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  26.47 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  27.59 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  31.06 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  27.81 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  28.41 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  29.38 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.17 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.17 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  26.22 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  27.2 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  27.2 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  26.35 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  26.35 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  28.82 
 
 		 664 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  25.75 
 
 		 348 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 671 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  29.41 
 
 		 671 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 671 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  30.15 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>