More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1566 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
227 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  64.16 
 
 
236 aa  251  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  34.87 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  30.63 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 
232 aa  115  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 
269 aa  111  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  32.57 
 
 
265 aa  109  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 
240 aa  109  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  36.17 
 
 
251 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  34.68 
 
 
217 aa  104  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  34.64 
 
 
224 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 
253 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 
214 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  30.29 
 
 
247 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  37.79 
 
 
279 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
220 aa  100  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  29.31 
 
 
262 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  33.87 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  32.76 
 
 
220 aa  99  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  33.71 
 
 
224 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.93 
 
 
216 aa  99.4  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  35.84 
 
 
220 aa  99  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  34.13 
 
 
349 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  33.54 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  32.18 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
348 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  33.53 
 
 
217 aa  95.9  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 
236 aa  95.5  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  32.93 
 
 
233 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  33.71 
 
 
222 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 
230 aa  95.1  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 
349 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  26.79 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 
270 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 
335 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
210 aa  92.8  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 
354 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 
221 aa  92  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 
241 aa  92  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  30.12 
 
 
293 aa  91.7  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  34.3 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  32.31 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 
339 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  29.34 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  28.99 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  26.11 
 
 
275 aa  89  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 
223 aa  88.6  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  27.88 
 
 
223 aa  88.2  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  31.74 
 
 
232 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  29.51 
 
 
256 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
251 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
241 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  32.93 
 
 
224 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 
228 aa  85.9  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 
299 aa  85.5  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 
229 aa  85.1  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  30.16 
 
 
225 aa  85.1  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  30 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  30 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  30.3 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  26.54 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  29.41 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  29.41 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  28 
 
 
246 aa  82  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  25.23 
 
 
284 aa  82  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  29.41 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  29.33 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  28.65 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  29.11 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  31.76 
 
 
671 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  31.76 
 
 
671 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  33.84 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  28.07 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 
664 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 
281 aa  79  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  27.51 
 
 
240 aa  79  0.00000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  27.57 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  27.78 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  27.78 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  28.24 
 
 
219 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  27.78 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  27.31 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  31.32 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  25.58 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  25.58 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  28.57 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  27.31 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.6 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>