212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0715 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  100 
 
 		 256 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  94.53 
 
 		 256 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  59.14 
 
 		 227 aa  304  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  70.2 
 
 		 269 aa  299  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  54.4 
 
 		 229 aa  280  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  62.18 
 
 		 220 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  61.26 
 
 		 217 aa  251  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  61.26 
 
 		 244 aa  248  8e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  48.94 
 
 		 216 aa  198  7.999999999999999e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  48.91 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  45.36 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  48.47 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  47.28 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  44.21 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  44.21 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  44.81 
 
 		 210 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  43.68 
 
 		 217 aa  178  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  44.81 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  44.26 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  37.6 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  43.78 
 
 		 218 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  43.78 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  43.78 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  41.85 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  41.62 
 
 		 220 aa  152  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  40.88 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  40.76 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  35.78 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  38.42 
 
 		 217 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  36.99 
 
 		 211 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 223 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  35.56 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  35.2 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  35.2 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  33.8 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  30.21 
 
 		 211 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  33.7 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  30.21 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  30.81 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  31.12 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  31.03 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  30.22 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  33.75 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 		 205 aa  98.6  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  28.73 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  30.94 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  26.94 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0900  hypothetical protein  31.63 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000692645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  29.22 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  27.47 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  33.72 
 
 		 173 aa  86.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  25.78 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  32.63 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  29.76 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  27.53 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  25.31 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  27.6 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  28.39 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  28.09 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  28.33 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  28.49 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  28.41 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  29.31 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4692  protein-disulfide isomerase-like protein  27.68 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  27.68 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2269  protein-disulfide isomerase  23.46 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  24.43 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  29.95 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  28.02 
 
 		 217 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  28.02 
 
 		 216 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  25.51 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  28.81 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0958  protein-disulfide isomerase  26.14 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0150276  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  29.49 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  28.81 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  28.81 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  27.42 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  27.22 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  27.42 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  24.19 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  24.24 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  25.87 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  28.25 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  24.55 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 231 aa  62  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  26.58 
 
 		 218 aa  62  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  26.58 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>