191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7654 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  100 
 
 		 214 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  91.12 
 
 		 214 aa  378  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  76.5 
 
 		 217 aa  343  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  76.04 
 
 		 217 aa  340  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  76.04 
 
 		 217 aa  340  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  72.9 
 
 		 214 aa  328  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  57.63 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  53.51 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  56.35 
 
 		 229 aa  204  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  50.85 
 
 		 269 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  45.97 
 
 		 210 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 243 aa  187  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  50.28 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  46.79 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  45.93 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  45.36 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  44.81 
 
 		 256 aa  175  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  45.93 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  45.5 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  45.66 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  46.33 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  44.8 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  46.24 
 
 		 270 aa  168  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  44.04 
 
 		 220 aa  167  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  44.44 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  42.53 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  41.36 
 
 		 220 aa  157  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  37.23 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  36.1 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  37.36 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  37.35 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  37.35 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  35.93 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  32.28 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  36.18 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  36.24 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  32.54 
 
 		 240 aa  101  7e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  31.63 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  30.37 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  33.56 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  34.2 
 
 		 257 aa  97.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  27.64 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  34.73 
 
 		 173 aa  86.3  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  31.49 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  32.57 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  30.17 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0900  hypothetical protein  28.81 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000692645  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 265 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 		 253 aa  78.2  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2268  protein-disulfide isomerase  28.43 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.873653  normal  0.987426 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2269  protein-disulfide isomerase  25.15 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  30.36 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  27.59 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  25.42 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  25.68 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  25.45 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  26.56 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  28.09 
 
 		 652 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  30.91 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  24.55 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  27.56 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  28.76 
 
 		 232 aa  62  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 335 aa  62  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  29.87 
 
 		 236 aa  62  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4692  protein-disulfide isomerase-like protein  25 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  28 
 
 		 652 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  25.29 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  33.71 
 
 		 671 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  33.71 
 
 		 671 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  30.06 
 
 		 349 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  30.25 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  26.06 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  25.29 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  25.89 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  33.15 
 
 		 671 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 		 293 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  23.53 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  25.44 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3118  Na+/H+ antiporter NhaA  25.32 
 
 		 644 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.875307  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  30.12 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  30.12 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  29.01 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  27.71 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  28.48 
 
 		 600 aa  55.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  29.01 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  26.11 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>