197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6941 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 214 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  91.12 
 
 		 214 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  76.04 
 
 		 217 aa  337  7e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  76.04 
 
 		 217 aa  333  7.999999999999999e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  76.04 
 
 		 217 aa  333  7.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  73.36 
 
 		 214 aa  327  7e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  60.11 
 
 		 229 aa  227  8e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  55.93 
 
 		 225 aa  213  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  54.29 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  49.12 
 
 		 269 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  44.55 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  48.26 
 
 		 243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  47.25 
 
 		 218 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  48 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  42.34 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  44.81 
 
 		 256 aa  174  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  44.26 
 
 		 256 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  45.54 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  46.52 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  45.25 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  46.61 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  45.41 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  46.03 
 
 		 270 aa  168  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  46.52 
 
 		 244 aa  168  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  42.79 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  43.86 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  41.82 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  37.68 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  36.1 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  38.97 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  37.36 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  38.18 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  38.55 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  35.64 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  39.7 
 
 		 205 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  36.46 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  31.58 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  32.71 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  32.65 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  33.54 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  32.75 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  34.25 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  34.2 
 
 		 257 aa  96.3  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  27.98 
 
 		 247 aa  91.7  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 247 aa  89  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  32.04 
 
 		 252 aa  85.5  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 		 265 aa  84.7  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  32.57 
 
 		 265 aa  84.7  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0900  hypothetical protein  29.21 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000692645  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2268  protein-disulfide isomerase  31.43 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.873653  normal  0.987426 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2269  protein-disulfide isomerase  26.9 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  27.68 
 
 		 255 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  28.16 
 
 		 249 aa  72  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  27.11 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  28.19 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  28.85 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  25.78 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  31.85 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  26.2 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  25.15 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  29.27 
 
 		 652 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4692  protein-disulfide isomerase-like protein  25.81 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  29.29 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  28.83 
 
 		 652 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  25 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  29.34 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  24.85 
 
 		 241 aa  62  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  24.54 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  28.08 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  26.79 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  30.12 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  25.88 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  26.82 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3226  Na+/H+ antiporter NhaA  30.67 
 
 		 627 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  27.56 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  28.85 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  27.16 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3118  Na+/H+ antiporter NhaA  27.95 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.875307  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  26.49 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  24.51 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  30.26 
 
 		 876 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  30.87 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  28.5 
 
 		 600 aa  55.1  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  26.99 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  24.18 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>