127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4693 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 		 247 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  38.27 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4692  protein-disulfide isomerase-like protein  36.49 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2269  protein-disulfide isomerase  33.78 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2268  protein-disulfide isomerase  35.18 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.873653  normal  0.987426 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0958  protein-disulfide isomerase  29.52 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0150276  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  31.58 
 
 		 227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  30.53 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  31.16 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  31.16 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  30.81 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  31.67 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  32.98 
 
 		 225 aa  109  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  31.16 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  31.33 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  34.12 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.99 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  29.36 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  30.89 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  32.74 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  32.57 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.58 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  30.29 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  30.29 
 
 		 228 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 220 aa  99  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  35.96 
 
 		 210 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.12 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  28.57 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  29.57 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  27.64 
 
 		 214 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  29.82 
 
 		 216 aa  91.7  9e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 		 214 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  30.29 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  30.17 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 224 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  29.71 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  27.96 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  31.36 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  28.07 
 
 		 211 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  23.85 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  23.94 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  26.64 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  24.1 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  34.71 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0900  hypothetical protein  25.13 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000692645  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  27.83 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  25.43 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  27.86 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  29.31 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  29.48 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  23.84 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  25.55 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  31.67 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  35.05 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  24.44 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  25.29 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  24.57 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  25.97 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  28 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  23.89 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  26.46 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  28 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  32.26 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  32.26 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  28.09 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  32.26 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  32.26 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  32.26 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  28.05 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  32.26 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  32.26 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2434  protein-disulfide isomerase-like protein  21.26 
 
 		 199 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.426803  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2482  putative lipoprotein  21.26 
 
 		 199 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.135487  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  24.28 
 
 		 236 aa  52  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  23.81 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  23.81 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  24.84 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  26.89 
 
 		 218 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  26.89 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  31.32 
 
 		 230 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0493  hypothetical protein  27.72 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  25.37 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02600  protein-disulfide isomerase  32.93 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  22.92 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>