111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0958 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0958  protein-disulfide isomerase  100 
 
 		 238 aa  495  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0150276  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2268  protein-disulfide isomerase  37.67 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.873653  normal  0.987426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4692  protein-disulfide isomerase-like protein  30.77 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  29.52 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  31.37 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2269  protein-disulfide isomerase  30.43 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  26.2 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  27.27 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  26.48 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.14 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  23.91 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  25.71 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  25.82 
 
 		 205 aa  72  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.32 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.14 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  25.58 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  23.84 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  26.35 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  26.35 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  28.09 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  25.4 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  26.46 
 
 		 218 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  25.6 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  26.14 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  25.58 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  26.35 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  26.97 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  23.04 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  23.33 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  24.61 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  23.81 
 
 		 220 aa  62  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  23.35 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  22.83 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  24.4 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  22.35 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  25.99 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  22.16 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  22.16 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  27.48 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  22.69 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  21.74 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  21.02 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  24.08 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  27.88 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  23.19 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  23.25 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  22.73 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  25.71 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  22.73 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  22.87 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  25.24 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  24.5 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  22.35 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  24.51 
 
 		 215 aa  52  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  21.23 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  23.89 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  21.76 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  25.33 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  25.88 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  22.35 
 
 		 236 aa  48.9  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.88 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  25.88 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.88 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.88 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.88 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.88 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  25.88 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.88 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  23.87 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  24.29 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  22.22 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  24.4 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  25.76 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  24.53 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  24.12 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  24.12 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  24.16 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  21.39 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  20.9 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  24.87 
 
 		 220 aa  45.4  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  24.35 
 
 		 255 aa  45.4  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  24.12 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  22.89 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  24.12 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  21.98 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  25.57 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  25.81 
 
 		 349 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  22.09 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  23.53 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>