More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3229 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  74.49 
 
 		 268 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  41.88 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  40.31 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  41.85 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  40.22 
 
 		 284 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  37.35 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 		 240 aa  139  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  42.2 
 
 		 348 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  42.2 
 
 		 349 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  42.77 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  41.04 
 
 		 349 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  41.92 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  39.31 
 
 		 354 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  41.18 
 
 		 232 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  37.67 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  40.12 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  36.42 
 
 		 335 aa  122  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  36.57 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  40.94 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  29.06 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  34.11 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  36.42 
 
 		 339 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 		 214 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 217 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  34.65 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  28.63 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  35.8 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  37.36 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  41.24 
 
 		 664 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  35.47 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  39.56 
 
 		 671 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  39.56 
 
 		 671 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  34.15 
 
 		 624 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 246 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  34.87 
 
 		 876 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  36.05 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  29.51 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  29.69 
 
 		 282 aa  99  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  30.28 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  36.77 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  39.56 
 
 		 671 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  30.37 
 
 		 233 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  36.09 
 
 		 652 aa  95.9  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  34.22 
 
 		 244 aa  95.5  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  34.22 
 
 		 217 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  37.2 
 
 		 553 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  38.04 
 
 		 188 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 182 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  33.71 
 
 		 652 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  33.88 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 		 228 aa  92  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  35.43 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  33.71 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  30.05 
 
 		 220 aa  89.4  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  30.27 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  36.36 
 
 		 616 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  26.87 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  36.14 
 
 		 172 aa  86.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  30.54 
 
 		 224 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 		 224 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  37.58 
 
 		 629 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 		 179 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  29.03 
 
 		 220 aa  85.9  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  37.42 
 
 		 311 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  36.13 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30.77 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  30.98 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  30.98 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  32.42 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  34.64 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  31.1 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  35.26 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  31.98 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  29.78 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  25.81 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  35.22 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  35 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  31.31 
 
 		 224 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  31.93 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  30.43 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>