More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1150 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 247 aa  508  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  52.21 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  46.69 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  48.18 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  41.22 
 
 		 263 aa  218  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  41.9 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  41.24 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  37.63 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  35.16 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  32.07 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  32.89 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  38.25 
 
 		 339 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  30.08 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  35.62 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  37.85 
 
 		 349 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  38.42 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  38.07 
 
 		 354 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  30.24 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  38.42 
 
 		 349 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  33.68 
 
 		 275 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  39.87 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  35.57 
 
 		 230 aa  112  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  34.66 
 
 		 335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  35.42 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  33.56 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.53 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  31.84 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  35.96 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  30.34 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.8 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  34.09 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  29.67 
 
 		 234 aa  98.6  8e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  33.15 
 
 		 217 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  33.15 
 
 		 217 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  29.2 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.72 
 
 		 244 aa  97.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  30.94 
 
 		 223 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  30.09 
 
 		 553 aa  96.3  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  26.75 
 
 		 251 aa  95.5  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  32.97 
 
 		 671 aa  95.1  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  32.97 
 
 		 671 aa  95.1  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  32.42 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  36.71 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  31.18 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  34.44 
 
 		 664 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  30.29 
 
 		 227 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 307 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 		 182 aa  92  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  34.07 
 
 		 671 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  28.96 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  34.81 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  31.49 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  27.24 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  30.56 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  29.78 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  32.7 
 
 		 616 aa  89.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  34.44 
 
 		 299 aa  89.4  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  31.49 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 214 aa  89  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  32.45 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  29.71 
 
 		 214 aa  89  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  30.51 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 182 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  30.5 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  29.56 
 
 		 624 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  31.43 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 		 270 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.79 
 
 		 286 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  27.57 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  29.57 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  30.59 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  27.57 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  32.19 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  35.63 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  26.88 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.52 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  28.09 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  30 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  33.56 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  27.93 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  33.33 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  33.56 
 
 		 311 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>