247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0545 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 269 aa  549  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  59.21 
 
 		 256 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  60.48 
 
 		 256 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  58.08 
 
 		 229 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  68.48 
 
 		 220 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  61.5 
 
 		 227 aa  275  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  62.89 
 
 		 217 aa  273  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  62.89 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  51.09 
 
 		 216 aa  212  5.999999999999999e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  52.57 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  51.38 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  55.23 
 
 		 270 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  51.67 
 
 		 217 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  51.67 
 
 		 217 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  51.11 
 
 		 217 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  50.55 
 
 		 225 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  47.15 
 
 		 210 aa  195  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  50.85 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  49.12 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  45.05 
 
 		 243 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  46.07 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  46.41 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  45.51 
 
 		 220 aa  165  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  43.82 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  38.46 
 
 		 223 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  42.61 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  43.35 
 
 		 224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  41.62 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  37.21 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  37.21 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  43.62 
 
 		 217 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  36.72 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  39.39 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  35.67 
 
 		 223 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  38.51 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  36.53 
 
 		 209 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  35.71 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  30.77 
 
 		 227 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  33.54 
 
 		 234 aa  109  5e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  31.72 
 
 		 247 aa  109  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 		 263 aa  105  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  35.96 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  31.87 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  31.52 
 
 		 240 aa  98.6  8e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 		 240 aa  98.6  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  33.12 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  29 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 214 aa  89.7  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0900  hypothetical protein  33.14 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000692645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  32.21 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 		 228 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 227 aa  86.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 246 aa  85.5  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  27.68 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  28.47 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4692  protein-disulfide isomerase-like protein  27.31 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  34.73 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  27.52 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  28.91 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  28.88 
 
 		 231 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  28.83 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  34.32 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  26.92 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  31.36 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  29.48 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2269  protein-disulfide isomerase  25.73 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  32.57 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0958  protein-disulfide isomerase  25.58 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0150276  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  26.47 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  26.8 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  26.8 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  27.13 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  23.44 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  31.17 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  27.39 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  23.5 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  27.53 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>