232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1661 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
251 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  69.96 
 
 
254 aa  342  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  45.87 
 
 
232 aa  198  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  40.28 
 
 
268 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  41.92 
 
 
269 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  36.05 
 
 
232 aa  115  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  38.22 
 
 
241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  34.85 
 
 
220 aa  113  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  37.57 
 
 
265 aa  113  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 
230 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 
214 aa  112  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  36.21 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  36.97 
 
 
348 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  36.97 
 
 
349 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  36.97 
 
 
349 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  39.26 
 
 
279 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
263 aa  106  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 
221 aa  102  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 
240 aa  102  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  34.94 
 
 
335 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  27 
 
 
219 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  32.27 
 
 
293 aa  99.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  36.08 
 
 
354 aa  98.6  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 
231 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  36.81 
 
 
253 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  36.17 
 
 
227 aa  92.8  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
242 aa  92.8  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  37.2 
 
 
664 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  31.6 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
339 aa  88.6  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  29.12 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  30.99 
 
 
226 aa  85.9  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  37.99 
 
 
553 aa  85.5  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  29.57 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  27.87 
 
 
251 aa  82  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  30.26 
 
 
275 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  36.59 
 
 
671 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  32.29 
 
 
671 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  32.29 
 
 
671 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 
263 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.3 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 
217 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  32.96 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  34.25 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  32.89 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  28.91 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  33.12 
 
 
624 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  27.06 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  28.92 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  30.73 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  33.13 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  29.09 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  33.53 
 
 
652 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.3 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  39.29 
 
 
270 aa  72  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  30.12 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  29.52 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  32.91 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  33.53 
 
 
652 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  29.7 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  25.82 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  25.45 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  29.88 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  23.44 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 
307 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  28.22 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  29.24 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  28.81 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  27.88 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  30.12 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  27.88 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  27.32 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  27.95 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  25.45 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  28.48 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  28.65 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  29.51 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  28.65 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  34.55 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  29.52 
 
 
390 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  30.89 
 
 
296 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0579  hypothetical protein  34.18 
 
 
179 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  29.52 
 
 
390 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  31.29 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  33.95 
 
 
876 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  26.88 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.381736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>