237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1068 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 224 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  90.05 
 
 		 222 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  84.82 
 
 		 224 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  79.19 
 
 		 233 aa  358  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  76.47 
 
 		 218 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  75.57 
 
 		 220 aa  348  5e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  74.77 
 
 		 220 aa  344  8e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  49.78 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  49.78 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  49.56 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  47.31 
 
 		 210 aa  184  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  45.5 
 
 		 214 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  48.33 
 
 		 229 aa  174  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  47.15 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  46.15 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  47.62 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  48.3 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  45.3 
 
 		 217 aa  161  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  44.75 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  45 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  43.26 
 
 		 269 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  39.9 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  38.86 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  39.9 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  39.9 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  38.5 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  38.76 
 
 		 223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  39.32 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  41.24 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  41.24 
 
 		 223 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  44.94 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  35.87 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  37.19 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  36.79 
 
 		 233 aa  127  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  40.12 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  41.95 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  34.92 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  37.36 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  37.36 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  35.24 
 
 		 257 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  31.73 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  32.16 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  33.88 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  31.93 
 
 		 253 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  34.92 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  30.29 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 268 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  31.49 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  29.12 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 		 247 aa  85.5  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  27.47 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  31.64 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  31.14 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  32.75 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  31.48 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  28.57 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  33.15 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  33.15 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  33.15 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 349 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  32.6 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  29.26 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0900  hypothetical protein  27.37 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000692645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  32.04 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  32.6 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  32.04 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  24.73 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  32.04 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  32.6 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  32.92 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  32.53 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  27.53 
 
 		 275 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  26.92 
 
 		 284 aa  71.6  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.13 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  30.27 
 
 		 313 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  29.94 
 
 		 671 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  29.58 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  25.65 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4692  protein-disulfide isomerase-like protein  26.74 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  27.88 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  27.51 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  29.38 
 
 		 652 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  26.78 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>