205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0716 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  100 
 
 		 214 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  75.12 
 
 		 217 aa  343  8.999999999999999e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  75.12 
 
 		 217 aa  343  8.999999999999999e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  74.65 
 
 		 217 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  72.9 
 
 		 214 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  73.36 
 
 		 214 aa  322  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  60.57 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  52.43 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  54.75 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  53.18 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  52.91 
 
 		 243 aa  198  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  46.92 
 
 		 210 aa  192  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  45.5 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  45.36 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  48.04 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  47.71 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  45.36 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  46.84 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  49.12 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  49.12 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  44.95 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  45.21 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  44.14 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  45.05 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  43.38 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  42.46 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  43.44 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  38.54 
 
 		 223 aa  145  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  40.76 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  37.37 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  38.14 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  38.54 
 
 		 233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  39.76 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  39.76 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  39.86 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  33.73 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  30.81 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  34.72 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  33.14 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  33.53 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  38.38 
 
 		 252 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  39.35 
 
 		 257 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  31.37 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  35.44 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0900  hypothetical protein  34.43 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000692645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  32.74 
 
 		 253 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  33.71 
 
 		 265 aa  90.9  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 		 247 aa  89.4  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2269  protein-disulfide isomerase  26.73 
 
 		 245 aa  85.5  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  31.97 
 
 		 265 aa  85.1  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 263 aa  84.7  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  34.91 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  29.09 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  29.28 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  26.46 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  34.36 
 
 		 349 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  33.74 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  31.71 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  33.74 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2268  protein-disulfide isomerase  28.98 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.873653  normal  0.987426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4692  protein-disulfide isomerase-like protein  25.81 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  31.06 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  28.81 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  25.58 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  28.14 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  29.09 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  27.22 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  26.49 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0958  protein-disulfide isomerase  23 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0150276  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  29.22 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  27.87 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  30.28 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  31.25 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  28.66 
 
 		 652 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 		 281 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  30.24 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  27.11 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  30.24 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  26.99 
 
 		 652 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>