More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0639 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
220 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  57.48 
 
 
221 aa  271  4.0000000000000004e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  46.55 
 
 
236 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  43.93 
 
 
214 aa  155  6e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  38.56 
 
 
265 aa  148  6e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  41.9 
 
 
247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 
240 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  41.85 
 
 
265 aa  142  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  41.92 
 
 
226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  38.98 
 
 
263 aa  135  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
231 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  34.63 
 
 
251 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  39.44 
 
 
349 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 
348 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  32.75 
 
 
268 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  35.47 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 
349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  32.99 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 
228 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
241 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  33.72 
 
 
293 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  30.68 
 
 
275 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 
269 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  37.28 
 
 
241 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  36.05 
 
 
339 aa  99.8  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  30.73 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  29.12 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  35.96 
 
 
354 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  30.96 
 
 
232 aa  95.9  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  36.31 
 
 
279 aa  95.9  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
299 aa  93.6  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  31.13 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  31.13 
 
 
219 aa  92.8  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  31.13 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 
335 aa  92.8  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  27.8 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  26.9 
 
 
217 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  26.9 
 
 
216 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 
217 aa  91.7  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  31.87 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  26.4 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  30.46 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  29.12 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  31.09 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  31.13 
 
 
217 aa  89.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  29.22 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  26.4 
 
 
219 aa  89  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  33.13 
 
 
282 aa  88.6  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  32.16 
 
 
218 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  25.89 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  25.89 
 
 
217 aa  87  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  29.06 
 
 
243 aa  85.5  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  31.66 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  29.78 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  30.32 
 
 
254 aa  81.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 
236 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30.59 
 
 
286 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  30.38 
 
 
307 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.24 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.24 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  28.08 
 
 
624 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  28.82 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  29.78 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  33.51 
 
 
553 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  26.97 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  33.11 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  30.61 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  27.91 
 
 
233 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 
269 aa  71.6  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  27.12 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 
664 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  28.86 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  28.38 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  24.04 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  28.75 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  28.75 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  29.14 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  28.49 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  30.06 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.61 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 
671 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 
671 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  30.22 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  27.01 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  24.41 
 
 
218 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  28.96 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>