More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1666 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  64.39 
 
 		 629 aa  726    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 652 aa  1286    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  92.33 
 
 		 652 aa  1123    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  45.98 
 
 		 624 aa  495  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  47.47 
 
 		 876 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  45.62 
 
 		 616 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  44.97 
 
 		 600 aa  399  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  39.05 
 
 		 630 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  39.59 
 
 		 613 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  39.59 
 
 		 613 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  39.59 
 
 		 613 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  38.6 
 
 		 617 aa  372  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  38.27 
 
 		 617 aa  365  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  41.77 
 
 		 470 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  39.28 
 
 		 465 aa  265  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  38.34 
 
 		 450 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  39.14 
 
 		 455 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  38.58 
 
 		 452 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  37.82 
 
 		 456 aa  239  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  37.59 
 
 		 449 aa  239  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  36.83 
 
 		 446 aa  236  9e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  40.65 
 
 		 426 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  37.68 
 
 		 423 aa  234  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  36.88 
 
 		 453 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  36.65 
 
 		 453 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  35.59 
 
 		 444 aa  231  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  37.56 
 
 		 451 aa  230  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  38.44 
 
 		 445 aa  226  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  36.54 
 
 		 475 aa  224  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  39.85 
 
 		 481 aa  219  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  35.61 
 
 		 446 aa  215  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  32.8 
 
 		 406 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  34.05 
 
 		 468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  34.47 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  35.2 
 
 		 402 aa  211  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  34.88 
 
 		 472 aa  210  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  36.84 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  35.8 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  35.8 
 
 		 436 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  37.29 
 
 		 404 aa  209  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.99 
 
 		 394 aa  208  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  37.68 
 
 		 457 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.1 
 
 		 421 aa  206  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  32.1 
 
 		 444 aa  206  1e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.79 
 
 		 391 aa  206  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.66 
 
 		 389 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.31 
 
 		 389 aa  205  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.66 
 
 		 389 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.54 
 
 		 391 aa  204  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.66 
 
 		 389 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  33.73 
 
 		 452 aa  204  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.41 
 
 		 389 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  31.32 
 
 		 427 aa  203  6e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.12 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.12 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.12 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  32.7 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.12 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.15 
 
 		 389 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.12 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  33.11 
 
 		 514 aa  201  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  33.24 
 
 		 464 aa  201  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.87 
 
 		 394 aa  201  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.5 
 
 		 398 aa  200  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.62 
 
 		 394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2568  Na+/H+ antiporter NhaA  37.05 
 
 		 424 aa  198  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  30.84 
 
 		 435 aa  198  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.58 
 
 		 388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  35.58 
 
 		 388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.58 
 
 		 388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.58 
 
 		 388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.58 
 
 		 388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.58 
 
 		 388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.58 
 
 		 388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  33.81 
 
 		 391 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.58 
 
 		 388 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.65 
 
 		 394 aa  197  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.25 
 
 		 398 aa  196  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.17 
 
 		 389 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.17 
 
 		 389 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  33.89 
 
 		 396 aa  196  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  35.31 
 
 		 388 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  30.8 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  31.01 
 
 		 379 aa  194  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2773  Na+/H+ antiporter NhaA  35.37 
 
 		 612 aa  192  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.461609 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.78 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  31.52 
 
 		 397 aa  191  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  30.24 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.83 
 
 		 399 aa  190  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  34.16 
 
 		 398 aa  190  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.6 
 
 		 398 aa  190  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.85 
 
 		 391 aa  188  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.51 
 
 		 391 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.25 
 
 		 391 aa  187  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  32.76 
 
 		 389 aa  186  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  35.14 
 
 		 439 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  31.39 
 
 		 424 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  32 
 
 		 391 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.38 
 
 		 409 aa  184  6e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  30.49 
 
 		 390 aa  183  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>