248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4372 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 233 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  78.73 
 
 		 218 aa  352  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  76.36 
 
 		 224 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  77.93 
 
 		 222 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  76.92 
 
 		 224 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  75.57 
 
 		 220 aa  332  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  73.64 
 
 		 220 aa  323  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  50.22 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  50.22 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  49.33 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  50.57 
 
 		 229 aa  174  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  45.66 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  51.14 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  47.95 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  46.88 
 
 		 229 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  45.26 
 
 		 217 aa  167  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  46.12 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  45.86 
 
 		 220 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  44.97 
 
 		 244 aa  164  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  47.09 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  40.71 
 
 		 227 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  46.56 
 
 		 214 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  43.85 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  43.78 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  42.21 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  43.78 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  43.33 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  38.98 
 
 		 223 aa  144  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  39.38 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  38.71 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  37.33 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  38.71 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  40.48 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  37.37 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  34.16 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  40.85 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  40.98 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  36.78 
 
 		 239 aa  120  3e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  36.78 
 
 		 240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  38.37 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  35.47 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  33.04 
 
 		 257 aa  105  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  30.89 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  32.85 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  32.22 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 269 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  31.49 
 
 		 247 aa  89.4  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 265 aa  89.4  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  32.77 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  32.92 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  31.74 
 
 		 284 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  31.76 
 
 		 275 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0900  hypothetical protein  28.12 
 
 		 230 aa  85.9  6e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000692645  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  27.12 
 
 		 263 aa  85.5  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 		 236 aa  85.1  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  31.74 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  29.77 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  30.68 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  27.49 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  33.13 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  31.45 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  28.31 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 339 aa  75.1  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  30.73 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  30.73 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  29.34 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  31.67 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  31.67 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  31.67 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  31.74 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  31.85 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  28.26 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  31.36 
 
 		 348 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  31.11 
 
 		 216 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  31.11 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  29.55 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  30.63 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  30.77 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  31.36 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2269  protein-disulfide isomerase  22.75 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  27.91 
 
 		 652 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  30.28 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>