241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1905 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 296 aa  609  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  54.48 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  61.39 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  61.39 
 
 		 276 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 		 671 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 		 671 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  37.2 
 
 		 671 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  35.96 
 
 		 664 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  41.32 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  41.32 
 
 		 348 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  41.32 
 
 		 349 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  38.69 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 335 aa  105  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  34.09 
 
 		 270 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  30.87 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  39.22 
 
 		 876 aa  95.9  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  34.81 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  32.03 
 
 		 624 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  30.19 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  35.81 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  30.19 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  32.49 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  35.29 
 
 		 616 aa  79  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  32.3 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  30.23 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  31.34 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  32.67 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  33.33 
 
 		 652 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  32.92 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  32.97 
 
 		 652 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  32.75 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  29.53 
 
 		 613 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  29.17 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  31.25 
 
 		 600 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  29.53 
 
 		 613 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  29.53 
 
 		 613 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  31.74 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  29.33 
 
 		 617 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  27.88 
 
 		 617 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  31.29 
 
 		 630 aa  67  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  34.16 
 
 		 629 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  31.72 
 
 		 553 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  30.28 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  29.52 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 		 241 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  26.25 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  25.17 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  25.17 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  30.89 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  29.75 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  29.56 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  32.75 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  30.82 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  27.35 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  29.84 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  28.26 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  27.39 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  24.19 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  28.47 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  28.3 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  26.18 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  28.1 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  27.45 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  25.61 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  30.28 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  23.63 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>