295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4951 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
262 aa  525  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  59.63 
 
 
172 aa  179  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  57.5 
 
 
188 aa  168  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  43.62 
 
 
182 aa  125  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  43.95 
 
 
196 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  45.89 
 
 
182 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  44.52 
 
 
616 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  44.38 
 
 
652 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  45.68 
 
 
629 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  40.67 
 
 
624 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  44.52 
 
 
876 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  41.22 
 
 
179 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  42.78 
 
 
652 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  41.61 
 
 
173 aa  105  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  40.13 
 
 
182 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 
249 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  35.27 
 
 
671 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  35.27 
 
 
671 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0579  hypothetical protein  33.99 
 
 
179 aa  99.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  32.97 
 
 
265 aa  98.6  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  32.68 
 
 
671 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  35.06 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  39.44 
 
 
179 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3230  DSBA oxidoreductase  44.97 
 
 
155 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0111  DSBA oxidoreductase  38.27 
 
 
185 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  36.88 
 
 
348 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 
265 aa  95.9  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  36.25 
 
 
349 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  34.25 
 
 
240 aa  95.1  9e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  36.88 
 
 
349 aa  95.1  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  40.79 
 
 
600 aa  92.4  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  41.18 
 
 
617 aa  92  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  33.56 
 
 
248 aa  92  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  41.56 
 
 
613 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  41.56 
 
 
613 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  41.56 
 
 
613 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  35.8 
 
 
664 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  29.12 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  29.78 
 
 
263 aa  90.5  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  39.61 
 
 
617 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  36.6 
 
 
553 aa  88.6  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  33.11 
 
 
269 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  36.25 
 
 
354 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  31.93 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  34.83 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 
288 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  32.39 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  33.74 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  38.03 
 
 
173 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  36.24 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  36.24 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 
232 aa  82  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  31.71 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  40.79 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  37.66 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  39.44 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  26.56 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  33.11 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  36.31 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  34.19 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 
335 aa  75.5  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  34.81 
 
 
630 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  36.24 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  30.82 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  35.29 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3118  Na+/H+ antiporter NhaA  39.47 
 
 
644 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.875307  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  28.98 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  37.68 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  29.5 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  29.5 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2375  DSBA oxidoreductase  35.81 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  33.79 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  29.75 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  32.3 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  36.36 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3226  Na+/H+ antiporter NhaA  36.42 
 
 
627 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  34.06 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  28.75 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  29.27 
 
 
222 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  36.18 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  28.83 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  25.71 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  31.97 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  29.22 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  36.55 
 
 
398 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  25.28 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.55 
 
 
286 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
219 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>