265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1985 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 179 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  48.72 
 
 		 196 aa  134  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  41.67 
 
 		 182 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  41.77 
 
 		 173 aa  127  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  41.03 
 
 		 624 aa  124  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  41.03 
 
 		 182 aa  121  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 876 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  40.38 
 
 		 616 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 		 265 aa  105  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  36.77 
 
 		 249 aa  105  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0111  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  39.49 
 
 		 600 aa  101  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 263 aa  100  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  32.54 
 
 		 349 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0579  hypothetical protein  34 
 
 		 179 aa  98.6  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 		 182 aa  99  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  41.22 
 
 		 262 aa  98.2  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  39.74 
 
 		 652 aa  97.8  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  31.95 
 
 		 348 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  38.12 
 
 		 613 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  35.48 
 
 		 339 aa  97.1  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  38.12 
 
 		 613 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  38.12 
 
 		 613 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  31.95 
 
 		 349 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  37.8 
 
 		 629 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  37.18 
 
 		 617 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 		 173 aa  95.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  36.77 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3230  DSBA oxidoreductase  36.77 
 
 		 155 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  36.67 
 
 		 617 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 		 265 aa  92.4  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  34.16 
 
 		 335 aa  92  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  32.35 
 
 		 354 aa  90.9  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  37.82 
 
 		 652 aa  91.3  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  36.2 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  36.08 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 240 aa  89  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 671 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 671 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 664 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  32.45 
 
 		 553 aa  87.8  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  30.95 
 
 		 671 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 262 aa  85.9  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 		 269 aa  85.5  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 268 aa  85.1  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  32.89 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  31.97 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 247 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 311 aa  77.8  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 311 aa  77.8  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  36.69 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  30.22 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  33.58 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  33.1 
 
 		 398 aa  74.7  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3226  Na+/H+ antiporter NhaA  33.95 
 
 		 627 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  30.05 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3118  Na+/H+ antiporter NhaA  32.3 
 
 		 644 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.875307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 219 aa  72  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  27.21 
 
 		 276 aa  71.2  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  32.4 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  35.62 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  26.16 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.98 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1537  Na+/H+ antiporter NhaA  34.87 
 
 		 624 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  22.47 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  34.04 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 257 aa  67.8  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 281 aa  67.8  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  28.98 
 
 		 336 aa  67.4  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 219 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 219 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 		 228 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 219 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  28.93 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  32.9 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  32.9 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  28.67 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2375  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 		 298 aa  65.1  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  28.32 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  29.37 
 
 		 630 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  31.29 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  28.05 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>