252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2358 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 179 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  78.29 
 
 		 182 aa  264  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  48.17 
 
 		 173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  48.78 
 
 		 196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  42.47 
 
 		 624 aa  131  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  42.94 
 
 		 652 aa  127  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  45.16 
 
 		 876 aa  124  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  47.68 
 
 		 629 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  36.94 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0111  DSBA oxidoreductase  40.62 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  42.76 
 
 		 652 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  44.06 
 
 		 616 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  36.42 
 
 		 228 aa  111  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  42.59 
 
 		 188 aa  111  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  41.56 
 
 		 613 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  41.56 
 
 		 613 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  41.56 
 
 		 613 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  36.77 
 
 		 179 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  41.38 
 
 		 617 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  41.83 
 
 		 617 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 		 348 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  40.62 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 		 349 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  33.53 
 
 		 349 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  39.73 
 
 		 630 aa  101  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  39.44 
 
 		 262 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  41.38 
 
 		 600 aa  97.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  34.73 
 
 		 354 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 		 288 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  35.98 
 
 		 671 aa  94.4  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  35.98 
 
 		 671 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 		 263 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  34.06 
 
 		 339 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  30.25 
 
 		 265 aa  93.2  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  39.13 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  34.18 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 265 aa  92.4  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  36.42 
 
 		 553 aa  90.9  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  35.37 
 
 		 671 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  28.75 
 
 		 335 aa  89  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  32.21 
 
 		 268 aa  88.2  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  29.63 
 
 		 270 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 235 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  32.67 
 
 		 269 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3230  DSBA oxidoreductase  38.67 
 
 		 155 aa  85.5  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  28.1 
 
 		 263 aa  85.1  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  37.68 
 
 		 219 aa  84.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0579  hypothetical protein  28.77 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  33.79 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  36.96 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 		 221 aa  80.9  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 		 221 aa  80.9  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 		 664 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  29.88 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  34.56 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  26.19 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  28.38 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  32.76 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  29.3 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  32.68 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  31.36 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  28.68 
 
 		 261 aa  72  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  28.68 
 
 		 261 aa  72  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  25.29 
 
 		 247 aa  72  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 		 273 aa  71.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  33.09 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 		 276 aa  71.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  29.58 
 
 		 306 aa  71.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  26.06 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  32.21 
 
 		 311 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  28.67 
 
 		 296 aa  70.9  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  32.21 
 
 		 311 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  34.31 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  25.45 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  25.45 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  34.31 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  26.35 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  27.95 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  33.57 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  26.88 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  28.92 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>