209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2159 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  100 
 
 		 221 aa  455  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  47.55 
 
 		 218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  43.78 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  54.37 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  45.62 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  45.62 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  42.65 
 
 		 208 aa  171  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  41.86 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  42.18 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  37.07 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  33.76 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  33.14 
 
 		 174 aa  89  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 235 aa  88.2  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  32.82 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 227 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  32.82 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 313 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  30.7 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  35.48 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  33.69 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  35.8 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  35.8 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  26.92 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  26.92 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  31.45 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  32.76 
 
 		 671 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  29.71 
 
 		 339 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  29.31 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  29.31 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 671 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 671 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  30.65 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  25.5 
 
 		 263 aa  62  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  28.38 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 		 335 aa  61.6  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  28.73 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  28.73 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  29.28 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  28.73 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  28.08 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  22.51 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  28.57 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  28.65 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  26.89 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 		 664 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  28.77 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  24 
 
 		 409 aa  58.9  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  31.4 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  26.85 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  22.59 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.27 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  26.22 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  35.71 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  25.64 
 
 		 270 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  26.22 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  30.2 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  24.34 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  27.74 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  26.17 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  30.29 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  27.16 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  30.17 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  30.19 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  27.68 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  34.41 
 
 		 311 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  34.41 
 
 		 311 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  26.95 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  21.31 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  26.71 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  22.64 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  26.75 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>