203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1646 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  59.15 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  54.37 
 
 		 221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  54.55 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  54.55 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 218 aa  171  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  48.75 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  38.5 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  41.45 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  41.96 
 
 		 228 aa  128  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  34.97 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  37.11 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  34.57 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  37.11 
 
 		 214 aa  95.9  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  38.78 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  37.09 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  37.75 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  37.09 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  30.19 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  35.44 
 
 		 223 aa  89.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 		 313 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  34.55 
 
 		 219 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  35.37 
 
 		 228 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  34.55 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  34.55 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  34.55 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  33.11 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  31.08 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  31.08 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  32.45 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  31.15 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  31.74 
 
 		 296 aa  71.2  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  31.36 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  27.97 
 
 		 409 aa  68.2  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  31.36 
 
 		 276 aa  67.8  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  33.52 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  35.62 
 
 		 652 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  33.1 
 
 		 876 aa  64.7  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 		 243 aa  62  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 		 243 aa  62  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  30.6 
 
 		 354 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  31.97 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  30.95 
 
 		 652 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  30.97 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  29.24 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 		 348 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  29.79 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  32.48 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  28.82 
 
 		 664 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  27.89 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  30.5 
 
 		 630 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  31.29 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  27.27 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  29.52 
 
 		 671 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  29.52 
 
 		 671 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  29.56 
 
 		 311 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  32.88 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  29.56 
 
 		 311 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  29.52 
 
 		 671 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  29.66 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  30.07 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  32.41 
 
 		 629 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  29.93 
 
 		 279 aa  54.7  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  26.38 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  29.52 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  27.33 
 
 		 624 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  27.34 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  27.34 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30.82 
 
 		 270 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 		 259 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  27.92 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  29.87 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  27.71 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  29.87 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 262 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.72 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  26.88 
 
 		 307 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  28.97 
 
 		 613 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  28.85 
 
 		 335 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  28.97 
 
 		 613 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>