239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11860 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  100 
 
 		 223 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  59.52 
 
 		 174 aa  194  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  57.14 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  54.97 
 
 		 237 aa  184  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  45.91 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  44.44 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  46.51 
 
 		 227 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  45.7 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  46.51 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  50.5 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  54.21 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  44.44 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  43.98 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  43.98 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  43.98 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  45.36 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  43.98 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  47.03 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  45.79 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  45.6 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  42.27 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  44.86 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  40.51 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  33.71 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  31.44 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  28.79 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  27.44 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 265 aa  89  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  33.09 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  32.35 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  39.16 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  35.58 
 
 		 671 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  29.55 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  33.09 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  29.06 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  35.58 
 
 		 671 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  25.68 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  35.58 
 
 		 671 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  28.93 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  37.66 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  29.73 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  34.52 
 
 		 616 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  33.66 
 
 		 876 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  33.57 
 
 		 624 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  32.88 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0579  hypothetical protein  28.47 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  31.52 
 
 		 553 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 		 664 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  32.02 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  35.21 
 
 		 617 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  28.51 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  25.73 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  42.21 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  37.57 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  31.62 
 
 		 336 aa  72  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  30.68 
 
 		 268 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  32.91 
 
 		 196 aa  72  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  35.44 
 
 		 600 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  35.04 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  36.62 
 
 		 617 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  30.17 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  29.96 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  32.3 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  26.34 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  32.64 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  26.34 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  27.56 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  26.34 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0111  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  26.34 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  30.28 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  37.06 
 
 		 652 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  31.88 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  27.42 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  30.26 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  26.87 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  35.29 
 
 		 630 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  25.12 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  26.11 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  25.25 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  29.17 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  25.56 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  28.44 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  29.17 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>