287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6579 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
336 aa  689    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 
348 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  31.71 
 
 
349 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 
349 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  29.32 
 
 
335 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  35.71 
 
 
553 aa  99.4  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 
354 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  34.42 
 
 
229 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  33.89 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  36.31 
 
 
671 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  36.31 
 
 
671 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  36.31 
 
 
671 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  39.51 
 
 
196 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  30.47 
 
 
311 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  30.47 
 
 
311 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  37.42 
 
 
227 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  37.76 
 
 
214 aa  90.9  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 
230 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  36.18 
 
 
214 aa  90.5  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 
664 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  38.67 
 
 
220 aa  89.7  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  36.43 
 
 
234 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  37.76 
 
 
876 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  31.07 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  36.73 
 
 
228 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 
221 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  36.69 
 
 
174 aa  86.7  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 
221 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  32.16 
 
 
263 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  36.48 
 
 
273 aa  85.9  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  36.48 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
253 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 
240 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  32.9 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  31.54 
 
 
235 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  32.03 
 
 
313 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  32.03 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
237 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  33.91 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  36.11 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  35.9 
 
 
652 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  33.09 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  31.06 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 
219 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 
247 aa  79  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  38.73 
 
 
188 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  34.67 
 
 
219 aa  77  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  31.61 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  36.6 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  36.31 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  31.45 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  31.45 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  31.45 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  36.13 
 
 
652 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  31.58 
 
 
624 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  32.05 
 
 
182 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.56 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  33.76 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  35.06 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  30.82 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  34.48 
 
 
613 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  33.33 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  34.48 
 
 
613 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  34.48 
 
 
613 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  31.62 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  32 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  34.03 
 
 
261 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  34.03 
 
 
261 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  28.98 
 
 
179 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  27.88 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  32.87 
 
 
630 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  30.34 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  30.3 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  37.5 
 
 
629 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  32.21 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  34.51 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  32.1 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  31.01 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  31.54 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  33.33 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  29.52 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  31.54 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3230  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  33.1 
 
 
617 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  30.97 
 
 
263 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  32.3 
 
 
268 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  32 
 
 
215 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>