219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2700 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  441  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  46.7 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  43 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  45.03 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  41.45 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  37.91 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  36.81 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 		 235 aa  98.2  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  28.44 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  29.55 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  32.61 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  31.45 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  26.54 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  26.54 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  26.54 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  31.1 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  33.78 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  33.78 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  26.54 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  33.11 
 
 		 349 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  29.11 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  29.94 
 
 		 270 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  31.25 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  30.91 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 		 671 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  31.21 
 
 		 671 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  30.64 
 
 		 671 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 		 276 aa  68.2  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  30.87 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  26.71 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  33.11 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  29.07 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  31.93 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  29.22 
 
 		 664 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  29.45 
 
 		 876 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  32.88 
 
 		 652 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  29.68 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  30.91 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  29.68 
 
 		 269 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  24.88 
 
 		 390 aa  61.6  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  29.66 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  28.47 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  28.47 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  28.19 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.19 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  30.82 
 
 		 652 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  26.7 
 
 		 600 aa  58.9  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  27.68 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  29.45 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  25.76 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  26.77 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  29.68 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  29.22 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  29.68 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  23.97 
 
 		 624 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  28.67 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  31.72 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  30.61 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  28.77 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  27.4 
 
 		 616 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  29.11 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  26.49 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  28 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  28 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  27.08 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>