More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0238 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  77.21 
 
 		 613 aa  892    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 617 aa  1224    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  77.21 
 
 		 613 aa  892    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  90.58 
 
 		 617 aa  1067    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  77.38 
 
 		 613 aa  895    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  57.29 
 
 		 630 aa  601  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  56.39 
 
 		 876 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  49.75 
 
 		 624 aa  537  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  47.37 
 
 		 616 aa  472  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  45.95 
 
 		 600 aa  450  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  42.65 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  38.72 
 
 		 652 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  38.27 
 
 		 652 aa  360  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  45.52 
 
 		 470 aa  334  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  43.08 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  44.2 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  38.52 
 
 		 472 aa  262  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0222  Na+/H+ antiporter NhaA  36.56 
 
 		 475 aa  259  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  35.29 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  33.64 
 
 		 450 aa  257  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  41 
 
 		 404 aa  256  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  35.19 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  37.92 
 
 		 456 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  38.2 
 
 		 449 aa  243  9e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  38.35 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  41.28 
 
 		 481 aa  238  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  35.32 
 
 		 444 aa  236  6e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.92 
 
 		 391 aa  236  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  34.4 
 
 		 450 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  35.37 
 
 		 464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  35.01 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  36.67 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  36.93 
 
 		 444 aa  234  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  36.67 
 
 		 453 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  35.56 
 
 		 438 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  36.71 
 
 		 445 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  36.58 
 
 		 452 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  38.85 
 
 		 455 aa  229  9e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  35.28 
 
 		 451 aa  227  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.82 
 
 		 390 aa  228  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  35.8 
 
 		 436 aa  226  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  35.41 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  34.89 
 
 		 446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  37.91 
 
 		 414 aa  223  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  37.62 
 
 		 457 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  36.05 
 
 		 434 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  37.53 
 
 		 423 aa  220  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  33.76 
 
 		 379 aa  219  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.87 
 
 		 430 aa  218  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  33.57 
 
 		 402 aa  216  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  33.59 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  38.61 
 
 		 432 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  34.33 
 
 		 391 aa  213  7.999999999999999e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  34.22 
 
 		 514 aa  213  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  32.37 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.58 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.58 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.58 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.58 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1537  Na+/H+ antiporter NhaA  34.22 
 
 		 624 aa  211  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192352  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.58 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.35 
 
 		 397 aa  211  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  35.84 
 
 		 453 aa  211  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.99 
 
 		 389 aa  209  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  35.44 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  34.56 
 
 		 391 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.33 
 
 		 394 aa  208  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.74 
 
 		 409 aa  208  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  33.94 
 
 		 383 aa  208  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  30.92 
 
 		 395 aa  207  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  34.33 
 
 		 396 aa  207  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  31.76 
 
 		 427 aa  206  7e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.53 
 
 		 399 aa  206  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  36.09 
 
 		 446 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0214  Na+/H+ antiporter NhaA  33.8 
 
 		 439 aa  205  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.01 
 
 		 401 aa  205  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.75 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.68 
 
 		 391 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.75 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.75 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.75 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  37.66 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.75 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.22 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  35.75 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.75 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  33.58 
 
 		 398 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.75 
 
 		 388 aa  204  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  35.75 
 
 		 388 aa  204  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  37.18 
 
 		 460 aa  204  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  34.9 
 
 		 425 aa  204  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  33.83 
 
 		 424 aa  203  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.13 
 
 		 391 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.33 
 
 		 399 aa  203  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.34 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  35.93 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.28 
 
 		 389 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.28 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.22 
 
 		 391 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.99 
 
 		 391 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>