90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0684 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 248 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  68.92 
 
 		 247 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0947  hypothetical protein  67.73 
 
 		 247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2185  hypothetical protein  68.13 
 
 		 247 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  64.85 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  62.87 
 
 		 254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  59.62 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  58.82 
 
 		 245 aa  262  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  62.63 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  59.24 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  56.58 
 
 		 261 aa  258  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  55.95 
 
 		 236 aa  202  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1768  protein-disulfide isomerase-like protein  44.26 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00864718  hitchhiker  0.000943846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4096  hypothetical protein  45.5 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  46.15 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  44 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0857  hypothetical protein  49.13 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.473961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36300  DSBA oxidoreductase  43.55 
 
 		 241 aa  148  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  45.24 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  43.71 
 
 		 217 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.85 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  33.72 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  33.7 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  28.78 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  28.29 
 
 		 335 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  22.12 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  25.6 
 
 		 354 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  31.69 
 
 		 624 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  24.06 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  34.94 
 
 		 182 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  30.68 
 
 		 652 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  28.83 
 
 		 652 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  25.24 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 664 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  27.74 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  27.52 
 
 		 281 aa  48.9  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 		 179 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  25.5 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  26.63 
 
 		 390 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  31.64 
 
 		 671 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  27.46 
 
 		 349 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  31.47 
 
 		 629 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  26.43 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  31.64 
 
 		 671 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  28.44 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  28.44 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  44 
 
 		 671 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  34.44 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  26.19 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  30.3 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  29.37 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  27.96 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  26.94 
 
 		 348 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  26.94 
 
 		 349 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 339 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  27.01 
 
 		 617 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  40.96 
 
 		 172 aa  45.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 182 aa  45.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  24.14 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2069  protein disulfide isomerase  30.14 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.191559999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  28.67 
 
 		 617 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  26.72 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  19.57 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  25.84 
 
 		 553 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  26.17 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  26.59 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4519  dsba oxidoreductase  41.82 
 
 		 59 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  35.42 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4638  hypothetical protein  24.07 
 
 		 342 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 227 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 		 307 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  25.32 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0850  hypothetical protein  25 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.842936  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  32.14 
 
 		 616 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  25.88 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  36.47 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  28.32 
 
 		 173 aa  42.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  30.14 
 
 		 233 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  27.94 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 223 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  26.6 
 
 		 267 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>