181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2069 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2069  protein disulfide isomerase  100 
 
 		 269 aa  554  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.191559999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  37.93 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  35.52 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  37.55 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1535  hypothetical protein  38.96 
 
 		 264 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.480424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2157  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.08 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  33.58 
 
 		 284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000197952  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.05 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.94 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.94 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.94 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.94 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.94 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  30.39 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.94 
 
 		 245 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.94 
 
 		 245 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  34.07 
 
 		 242 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  28.74 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  32.97 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  33.13 
 
 		 241 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  32.4 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  31.84 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  32.42 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  31.84 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  31.84 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  34.08 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  31.84 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  31.93 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  28.57 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  29.49 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  29.27 
 
 		 236 aa  93.2  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.27 
 
 		 236 aa  93.2  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  30.17 
 
 		 252 aa  92.4  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.71 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.86 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  28.99 
 
 		 235 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  28.25 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  30.81 
 
 		 248 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  30.81 
 
 		 248 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.29 
 
 		 246 aa  89.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  30.94 
 
 		 241 aa  88.6  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  30.86 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.95 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  29.78 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  25.85 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.03 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.66 
 
 		 247 aa  85.9  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  28.12 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  26.55 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  27.01 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  30.85 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  33.16 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.49 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.61 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.48 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.19 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.08 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  28.21 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  28.43 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  29.38 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.99 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.73 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.99 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.99 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.5 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.11 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  28.49 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.5 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.5 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.52 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.95 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  25.73 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.8 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.5 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  28.75 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  26.42 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  27.03 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.11 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  25.9 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.08 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  25.7 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.08 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  23.85 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  24.63 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.96 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  35.44 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  25.3 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.37 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  28.82 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  29.84 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.12 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  28.02 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.41 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.37 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  25.53 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.14 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.36 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.36 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  26.96 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>