78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1623 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  49.3 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  45.16 
 
 		 247 aa  211  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  43.91 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  45.23 
 
 		 261 aa  208  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  42.62 
 
 		 254 aa  208  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  49.04 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  49.04 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0947  hypothetical protein  45.5 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  46.45 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  48.68 
 
 		 248 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2185  hypothetical protein  43.48 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  47.64 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  40.97 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1768  protein-disulfide isomerase-like protein  42.16 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00864718  hitchhiker  0.000943846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0857  hypothetical protein  43.02 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.473961  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4096  hypothetical protein  38.92 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36300  DSBA oxidoreductase  39.01 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  43.37 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  41.86 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  26.55 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  34 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  28.31 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  26.13 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  25.71 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4638  hypothetical protein  25.58 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  25.95 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  30.28 
 
 		 182 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  21.67 
 
 		 313 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  23 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  25.14 
 
 		 335 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  26.49 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  24.03 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  23.12 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  22.3 
 
 		 221 aa  49.7  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  22.7 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  34.94 
 
 		 172 aa  48.9  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  25.81 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0862  DSBA oxidoreductase  23.38 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00262563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  23.76 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  29.73 
 
 		 652 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  27.71 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 179 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  25.22 
 
 		 600 aa  46.2  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  24.34 
 
 		 220 aa  45.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 		 269 aa  45.4  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  23.08 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.21 
 
 		 244 aa  45.4  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  24.1 
 
 		 265 aa  45.4  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.03 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  25.62 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3762  hypothetical protein  27.54 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  22.46 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  20.19 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  23.67 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  33.73 
 
 		 652 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  21.48 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  26.88 
 
 		 624 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  24.26 
 
 		 288 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  26.52 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  26.47 
 
 		 398 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  25.44 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  23.81 
 
 		 293 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  25.75 
 
 		 354 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  23.7 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  23.33 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  22.37 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  23.7 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 671 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 671 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  32.31 
 
 		 204 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  35.29 
 
 		 671 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>