74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1183 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  85.06 
 
 		 261 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  77.95 
 
 		 254 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  82.28 
 
 		 254 aa  394  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  82.68 
 
 		 254 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  79.84 
 
 		 245 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  52.34 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  61.38 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0947  hypothetical protein  53.36 
 
 		 247 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  52.97 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2185  hypothetical protein  52.17 
 
 		 247 aa  228  9e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1768  protein-disulfide isomerase-like protein  50.99 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00864718  hitchhiker  0.000943846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  52.33 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4096  hypothetical protein  48.02 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  46.45 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  43.46 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36300  DSBA oxidoreductase  47.65 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0857  hypothetical protein  43.82 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.473961  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  42.51 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  42.17 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  33.97 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 		 276 aa  89.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 182 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  24.58 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  29.17 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  25.9 
 
 		 281 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  25.79 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 671 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 671 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  33.9 
 
 		 671 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  30.82 
 
 		 307 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  26.79 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  25.83 
 
 		 335 aa  49.3  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4638  hypothetical protein  22.67 
 
 		 342 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  24.73 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  30.94 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  22.43 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1712  hypothetical protein  32.48 
 
 		 208 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328153  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  26 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  25.32 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  42.31 
 
 		 664 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  29.51 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  29.27 
 
 		 652 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  28.07 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  27.15 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  27.7 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  25.11 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1535  hypothetical protein  32.79 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.480424  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  26.8 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  32.79 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  20.25 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  23.67 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  25.54 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 210 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  28.81 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  26.9 
 
 		 652 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  23.7 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2157  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.79 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  27.12 
 
 		 220 aa  42.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 204 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  20.65 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  28.57 
 
 		 624 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  21.84 
 
 		 228 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  32.61 
 
 		 236 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.76 
 
 		 262 aa  42  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>