99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0501 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  55.03 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  50.48 
 
 		 247 aa  218  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  56.32 
 
 		 254 aa  218  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  46.55 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  55.17 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  51.6 
 
 		 245 aa  212  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  54.12 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0947  hypothetical protein  51.9 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  55.56 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  55.95 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2185  hypothetical protein  50.95 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1768  protein-disulfide isomerase-like protein  41.96 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00864718  hitchhiker  0.000943846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  40.85 
 
 		 246 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  44.5 
 
 		 228 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0857  hypothetical protein  43.12 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.473961  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4096  hypothetical protein  38.84 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36300  DSBA oxidoreductase  42.01 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  42.11 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  40.72 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.82 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  29.07 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  30.98 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  26.88 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  27.81 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  26.62 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  26.92 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  24.02 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  32.78 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  29.37 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  23.56 
 
 		 265 aa  51.6  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  43.02 
 
 		 172 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  26.94 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 339 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  24.84 
 
 		 671 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  24.12 
 
 		 294 aa  49.7  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  29.07 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  24.84 
 
 		 671 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  25.81 
 
 		 267 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  28.26 
 
 		 281 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  24.26 
 
 		 664 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  26.12 
 
 		 255 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  22.67 
 
 		 269 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  23.4 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0862  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00262563  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  24.22 
 
 		 671 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  24.87 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  25.97 
 
 		 652 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  25.88 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  25.27 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  26.38 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  24.32 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  29.05 
 
 		 311 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  36.14 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  23.16 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4638  hypothetical protein  21.08 
 
 		 342 aa  45.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  25.71 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  24.12 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 		 291 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  28.47 
 
 		 307 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  21.78 
 
 		 262 aa  45.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  22.16 
 
 		 265 aa  45.4  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  27.18 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  24.85 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  28.28 
 
 		 616 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  36.07 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  26.71 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  25.29 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.38 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  27.7 
 
 		 311 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  27.7 
 
 		 311 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  23.12 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  26.8 
 
 		 652 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  25.37 
 
 		 876 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  23.87 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  23.68 
 
 		 398 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  25.6 
 
 		 253 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  25.89 
 
 		 624 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1535  hypothetical protein  22.89 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.480424  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  25.79 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  24.29 
 
 		 299 aa  42.4  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  25.79 
 
 		 207 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  27.74 
 
 		 629 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  21.15 
 
 		 228 aa  42  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  34.02 
 
 		 617 aa  42.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  28.83 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2157  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.74 
 
 		 265 aa  42  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  25.79 
 
 		 207 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  27.94 
 
 		 262 aa  41.6  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>