66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1224 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 244 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  38.01 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  40.8 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  40.8 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  40.8 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  35.67 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  39.19 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  39.01 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 		 276 aa  95.1  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  30.12 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  36.56 
 
 		 307 aa  89.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  30.64 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 		 237 aa  85.5  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  34.09 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  30.63 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  33.1 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  33.82 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  32.56 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  30.12 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  32.93 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  34 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  33.77 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  36.13 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  32.08 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  29.31 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  34.86 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  29.71 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  30.49 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02600  protein-disulfide isomerase  29.68 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  36.11 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  27.65 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  30.18 
 
 		 335 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  30.89 
 
 		 566 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  27.33 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  26.84 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  26.27 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  27.06 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  27.06 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  29.14 
 
 		 307 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  29.88 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  27.92 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  27.93 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  26.01 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  26.89 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  22.79 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  25.35 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  29.09 
 
 		 337 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  25.79 
 
 		 269 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  28.23 
 
 		 220 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  28.23 
 
 		 220 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  28.23 
 
 		 220 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0977  hypothetical protein  29.03 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  24.73 
 
 		 313 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  29.14 
 
 		 348 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  29.14 
 
 		 349 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  26.75 
 
 		 323 aa  42.4  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  31.13 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>