52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1686 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 
307 aa  615  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  36.51 
 
 
248 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  38.42 
 
 
566 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  35.58 
 
 
248 aa  109  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  31.73 
 
 
257 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  36.82 
 
 
254 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  36.02 
 
 
252 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  36.02 
 
 
252 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  36.02 
 
 
252 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  30.59 
 
 
257 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  37.63 
 
 
244 aa  96.3  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  35.92 
 
 
268 aa  95.9  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  29.92 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  35.26 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 
237 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  29.35 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  30.85 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  26.29 
 
 
252 aa  79  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  35.9 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  27.53 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  30.04 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  29.39 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  28.73 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  28.7 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  29.52 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
256 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  31.29 
 
 
277 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1454  protein-disulfide isomerase  26.83 
 
 
324 aa  63.9  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  31.62 
 
 
192 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  29.27 
 
 
276 aa  63.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  31.54 
 
 
247 aa  62.8  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  30.29 
 
 
254 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  27.71 
 
 
220 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  27.71 
 
 
220 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  27.71 
 
 
220 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  30 
 
 
276 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  27.11 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  32.2 
 
 
312 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 
291 aa  55.8  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  25.81 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 
221 aa  53.9  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0977  hypothetical protein  25.56 
 
 
229 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02600  protein-disulfide isomerase  30 
 
 
240 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  28.03 
 
 
316 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  24.56 
 
 
279 aa  46.2  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5261  hypothetical protein  32.89 
 
 
227 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.98331  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  26.38 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  32.91 
 
 
299 aa  43.9  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 
242 aa  42.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>