41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0066 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  671    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  57.53 
 
 		 319 aa  356  3.9999999999999996e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1454  protein-disulfide isomerase  41.77 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  29.7 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  26.26 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  28.95 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  24.48 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  29.24 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  30.16 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  25 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  28.29 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  23.13 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  27.07 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  27.07 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  27.07 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  33.88 
 
 		 566 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  23.72 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  30.89 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  30.08 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  26.74 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 		 246 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  25.37 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  28.21 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  27.17 
 
 		 220 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5261  hypothetical protein  28.57 
 
 		 227 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.98331  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  27.17 
 
 		 220 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  27.17 
 
 		 220 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  25.14 
 
 		 276 aa  53.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  27.98 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  30.56 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  27.64 
 
 		 257 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 		 270 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  31.31 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0977  hypothetical protein  25.29 
 
 		 229 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  29.85 
 
 		 244 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  25.61 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  23.29 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  25.71 
 
 		 256 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>