54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31660 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  552  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  44.6 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  46.45 
 
 		 277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  42.12 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  36.02 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  35.11 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  36.11 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  32.6 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  34.21 
 
 		 291 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  32.46 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  32.59 
 
 		 237 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  30.6 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  31.58 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  34.38 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  30.25 
 
 		 238 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  33.51 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  30.57 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  28.9 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  29.28 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  27.52 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.54 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  31.19 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  28.16 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  27.08 
 
 		 257 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  32.39 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  28.75 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  26.94 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  29.65 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  26.07 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  24.36 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  24.36 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  24.36 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  26.61 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1454  protein-disulfide isomerase  26.34 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  24.9 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  29.63 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  31.72 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  25.55 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  28.41 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  29.94 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  23.76 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  28.34 
 
 		 248 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  28.5 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  29.09 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  29.82 
 
 		 566 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02600  protein-disulfide isomerase  25.95 
 
 		 240 aa  48.9  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  24.57 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  28.85 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0283  DsbA-like thioredoxin  26.42 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.144264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>