99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5707 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  100 
 
 		 282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  34.64 
 
 		 330 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  34.2 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  31.98 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 237 aa  89  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  32.42 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  29.48 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  31.15 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  25.27 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  27.76 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  29.69 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  29.89 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  25 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  28.42 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  27.65 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  26.36 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  24.74 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  25.31 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  27.44 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  27.44 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  26.32 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  27.44 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  27.37 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  26.36 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  22.82 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  30.34 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  29.38 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  27.84 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  26.01 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02600  protein-disulfide isomerase  26.38 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  28.88 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  26.4 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  23.35 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  25.32 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  26.94 
 
 		 671 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  27.27 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  25.32 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  26.94 
 
 		 671 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  25.15 
 
 		 228 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 316 aa  53.1  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  31.16 
 
 		 337 aa  52.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  28.42 
 
 		 248 aa  52.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  25.3 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  25.83 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  26.72 
 
 		 219 aa  50.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  24.66 
 
 		 227 aa  49.7  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  24.03 
 
 		 217 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  26.01 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  24.73 
 
 		 349 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  24.73 
 
 		 348 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  28.33 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  26.46 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  24.73 
 
 		 349 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  25.33 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 		 262 aa  46.2  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  32.23 
 
 		 218 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  24.73 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  23.21 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  22.7 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  26.26 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  24.32 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  31.39 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  26.28 
 
 		 664 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  27.13 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  27.4 
 
 		 671 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  27.6 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  23.97 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  24.18 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  26.28 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  26.28 
 
 		 228 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  23.25 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  26.89 
 
 		 219 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  24.2 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  26.82 
 
 		 236 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  25.1 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  23.5 
 
 		 230 aa  42.7  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 		 335 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 		 242 aa  42.7  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  25.44 
 
 		 313 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 		 254 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  24.2 
 
 		 217 aa  42  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  24.2 
 
 		 216 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>