62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1168 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  689    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  51.23 
 
 		 326 aa  296  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  47.19 
 
 		 247 aa  155  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  40.85 
 
 		 254 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  45.93 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  32.13 
 
 		 276 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  39.37 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  30.35 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  34.21 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  27.31 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  28.79 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  30.6 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  32.8 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  39.66 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  38.21 
 
 		 275 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  35.34 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  37.07 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  29.52 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  29.94 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  29.07 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  27.88 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  24.34 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  28.82 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  27.44 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5261  hypothetical protein  31.72 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.98331  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  34.31 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 312 aa  53.5  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  26.24 
 
 		 276 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  28.03 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  37.27 
 
 		 248 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 		 265 aa  50.4  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  31.36 
 
 		 230 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  32.35 
 
 		 282 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  25.85 
 
 		 291 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 		 243 aa  49.7  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 		 240 aa  49.7  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  40.3 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  33.93 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  33.33 
 
 		 282 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  31.18 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  31.63 
 
 		 220 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  38.55 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  31.63 
 
 		 220 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  31.63 
 
 		 220 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  28.97 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  25.21 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  26.79 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  41.18 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  28.78 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  29.33 
 
 		 257 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 221 aa  43.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  27.94 
 
 		 253 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  27.11 
 
 		 265 aa  42.7  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 		 228 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  31.15 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  30.25 
 
 		 218 aa  42.7  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>