68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3171 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  51.71 
 
 		 337 aa  294  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  37.61 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  45.95 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  43.75 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  26.81 
 
 		 276 aa  86.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  30.67 
 
 		 276 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  28.5 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  32.77 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  32.4 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  32.26 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  34.97 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 		 238 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  35 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  32.23 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  35.43 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  27.34 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  31.25 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  36.75 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  29.27 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  30.85 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  25.23 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  30.17 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  29.34 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.61 
 
 		 192 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  32.33 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  32.43 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  26.4 
 
 		 247 aa  53.9  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  32.43 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  32.43 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  25.75 
 
 		 312 aa  53.1  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  34.68 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  25.26 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  34.21 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 244 aa  50.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 		 217 aa  49.7  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 		 214 aa  49.3  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  30.29 
 
 		 242 aa  49.3  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  27.27 
 
 		 216 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  30.83 
 
 		 244 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  26.98 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  25.16 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  27.59 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  23.73 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  29.56 
 
 		 250 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  28.89 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  26.19 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  26.35 
 
 		 216 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  37.65 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  27.12 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  26.55 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  26.55 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  26.19 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  26.55 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  25.32 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  26.67 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  26.55 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 		 230 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  24.14 
 
 		 248 aa  43.9  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  44.44 
 
 		 221 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  28 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>