79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2943 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  56.5 
 
 
247 aa  275  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  44.74 
 
 
256 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  39.34 
 
 
337 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  36.7 
 
 
326 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  31.56 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  31.88 
 
 
238 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  31.06 
 
 
237 aa  92.4  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  32.03 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  31.97 
 
 
276 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  33.14 
 
 
276 aa  86.3  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  32 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
244 aa  79  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  27.52 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  27.74 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  28.76 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  26.87 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  27.84 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  26.26 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  26.07 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  26.12 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  25.58 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  27.54 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  32.64 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  28.72 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  28.72 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  28.72 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  30.14 
 
 
257 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  30.3 
 
 
282 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  24.72 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  35.71 
 
 
307 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  26.85 
 
 
223 aa  60.1  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 
348 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  27.11 
 
 
349 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  27.38 
 
 
349 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 
231 aa  55.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  24.2 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  25.67 
 
 
312 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  22.78 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  28.39 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  35.63 
 
 
277 aa  52  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  22.54 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  28.39 
 
 
335 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  26.04 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  24.14 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  24.64 
 
 
319 aa  46.6  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  21.03 
 
 
265 aa  46.2  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  28.57 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  33.75 
 
 
265 aa  45.8  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 
307 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  21.5 
 
 
282 aa  45.4  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  25.17 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  25.83 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  26.47 
 
 
220 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  23.6 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2482  putative lipoprotein  24.55 
 
 
199 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.135487  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  24.85 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2434  protein-disulfide isomerase-like protein  24.55 
 
 
199 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.426803  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  24.85 
 
 
223 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.13 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  23.83 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  24.48 
 
 
230 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  26.92 
 
 
311 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  25.88 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  27.38 
 
 
664 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  22.69 
 
 
241 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  23.57 
 
 
240 aa  42.7  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  22.6 
 
 
220 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  22.6 
 
 
220 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  22.6 
 
 
220 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  24.66 
 
 
217 aa  42  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>