144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5706 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 
330 aa  671    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  45.56 
 
 
276 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  34.26 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  32.29 
 
 
238 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  31.05 
 
 
276 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  37.74 
 
 
254 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  33.33 
 
 
276 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  26.03 
 
 
237 aa  99.4  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  29.46 
 
 
237 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  29.89 
 
 
252 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  28.83 
 
 
254 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  28.75 
 
 
264 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  29.24 
 
 
232 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  31.96 
 
 
244 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  30.05 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  31.49 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  26.61 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  26.47 
 
 
250 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  28.32 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  31.64 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 
296 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 
217 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  25.56 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  29.01 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  28.3 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  23.43 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  26.05 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  28.75 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  29.57 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  29.22 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  29.22 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  29.22 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  26.32 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  29.22 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  32.89 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  29.22 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  27.95 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  29.22 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  29.22 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  29.22 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  26.69 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  28.57 
 
 
219 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  34.42 
 
 
230 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  28.72 
 
 
349 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
335 aa  67  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  29.49 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  29.46 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  28.68 
 
 
285 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  25.28 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  28.76 
 
 
256 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
263 aa  63.9  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 
251 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  31.74 
 
 
316 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  28.32 
 
 
268 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  27.52 
 
 
241 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  26.22 
 
 
218 aa  59.3  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  24.67 
 
 
218 aa  59.3  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  27.92 
 
 
664 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  27.18 
 
 
279 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  23.87 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 
218 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 
241 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  25.86 
 
 
311 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  24.4 
 
 
252 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  24.4 
 
 
252 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  24.4 
 
 
252 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  27.4 
 
 
226 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  25.17 
 
 
275 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  24.88 
 
 
223 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  23.33 
 
 
313 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  24.14 
 
 
248 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  27.38 
 
 
671 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  26.06 
 
 
255 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  25.49 
 
 
624 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  27.38 
 
 
671 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 
244 aa  53.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  28.57 
 
 
671 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  28 
 
 
337 aa  52.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  28.25 
 
 
248 aa  52.8  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  27.22 
 
 
282 aa  52.8  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 
281 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0283  DsbA-like thioredoxin  25.15 
 
 
232 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.144264  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  22.52 
 
 
214 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>