125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1454 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 		 247 aa  507  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  56.5 
 
 		 254 aa  294  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  41.54 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  44.93 
 
 		 337 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  36.95 
 
 		 237 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  34.57 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  41.18 
 
 		 326 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  33.48 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  35.33 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  32.51 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  30.2 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  29.58 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  32.49 
 
 		 270 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  37.2 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  28.49 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  30.08 
 
 		 296 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  28.29 
 
 		 276 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  26.61 
 
 		 276 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  30.64 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  30.74 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  30.84 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  30.38 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  30.99 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  27.44 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  27.16 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  38.22 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  25.09 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  27.11 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  30.92 
 
 		 349 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  30.23 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  27.44 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  24.81 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  25.66 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  27.32 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  25 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  23.19 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  27.86 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  23.56 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  30.06 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  30.06 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  30.06 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  25.15 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  20.91 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.64 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  26.15 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  23.21 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  26.32 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  30.67 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  26.43 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  24.71 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  24.64 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  26 
 
 		 299 aa  53.9  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  30.88 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  26.04 
 
 		 339 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  26.75 
 
 		 335 aa  52  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  26.24 
 
 		 624 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  25.42 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  25.57 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.14 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  24.54 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  24.42 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  24.59 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  25.48 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  28.19 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  24.04 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  24.16 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  25.77 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  26.63 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0026  hypothetical protein  25.65 
 
 		 433 aa  49.3  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727163  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  24.4 
 
 		 218 aa  49.3  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  25.15 
 
 		 566 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  26.78 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  28.04 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  27.61 
 
 		 269 aa  48.5  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  23.74 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.05 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  24.76 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 354 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  25.14 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  24.16 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  26.11 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  26.11 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>