178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4517 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  100 
 
 
217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  95.28 
 
 
219 aa  370  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36300  DSBA oxidoreductase  54.82 
 
 
241 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  50.86 
 
 
228 aa  178  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0857  hypothetical protein  48.82 
 
 
234 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.473961  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  41.59 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  43.18 
 
 
247 aa  154  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  46.71 
 
 
248 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  45.18 
 
 
245 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  42.63 
 
 
254 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0947  hypothetical protein  45.24 
 
 
247 aa  141  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  43.27 
 
 
254 aa  141  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  43.98 
 
 
254 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  43.98 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  44.58 
 
 
254 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  40.72 
 
 
236 aa  138  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2185  hypothetical protein  45.83 
 
 
247 aa  134  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4096  hypothetical protein  37.33 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1768  protein-disulfide isomerase-like protein  39.88 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00864718  hitchhiker  0.000943846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  39.36 
 
 
246 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.14 
 
 
286 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 
257 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  32.67 
 
 
276 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4519  dsba oxidoreductase  77.78 
 
 
59 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  28.8 
 
 
652 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 
335 aa  65.1  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  28.85 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  29.14 
 
 
268 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 
238 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 
240 aa  62.4  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  29.93 
 
 
260 aa  62  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  28.25 
 
 
652 aa  61.6  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  27.22 
 
 
249 aa  61.6  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 
262 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 
354 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  25.35 
 
 
265 aa  58.5  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  26.37 
 
 
231 aa  58.5  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 
664 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  28.77 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  28.73 
 
 
275 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  31.21 
 
 
311 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  27.95 
 
 
267 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 
288 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 
339 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  26.92 
 
 
270 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  27.11 
 
 
247 aa  55.5  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  27.86 
 
 
349 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
335 aa  55.5  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 
311 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  26.19 
 
 
671 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  26.19 
 
 
671 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 
311 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  26.82 
 
 
307 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  31.46 
 
 
234 aa  53.5  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 
348 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  29.93 
 
 
876 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  28.64 
 
 
671 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
265 aa  53.1  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 
281 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  50 
 
 
172 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  24.63 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  29.38 
 
 
284 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
173 aa  52.4  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 
349 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  25.37 
 
 
239 aa  52  0.000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  25.3 
 
 
220 aa  52  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  21.76 
 
 
250 aa  51.6  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  25.32 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  25.12 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.59 
 
 
253 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  35.48 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  26.78 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  26.38 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  24.1 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  26.86 
 
 
624 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  25.34 
 
 
262 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  31.91 
 
 
390 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.3 
 
 
217 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  24.42 
 
 
222 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  26.11 
 
 
600 aa  48.9  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.45 
 
 
244 aa  48.9  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 
251 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  23.76 
 
 
250 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
281 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  25.67 
 
 
313 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 
241 aa  48.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  21.09 
 
 
263 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.85 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  26.84 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  23.53 
 
 
207 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  23.53 
 
 
207 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  24.57 
 
 
229 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  23.53 
 
 
207 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.85 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>