64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3425 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  77.78 
 
 		 261 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  78.74 
 
 		 254 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  78.37 
 
 		 245 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  77.95 
 
 		 254 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  77.95 
 
 		 254 aa  353  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  52.08 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  61.9 
 
 		 248 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0947  hypothetical protein  52.42 
 
 		 247 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  55.7 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2185  hypothetical protein  53.2 
 
 		 247 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  52.98 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1768  protein-disulfide isomerase-like protein  44.1 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00864718  hitchhiker  0.000943846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  49.74 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4096  hypothetical protein  38.4 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  42.53 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0857  hypothetical protein  44.33 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.473961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36300  DSBA oxidoreductase  43.92 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  42.01 
 
 		 219 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  41.57 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.75 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  31.36 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  32.74 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  26.23 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  31.54 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  24.18 
 
 		 313 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  25.88 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  30.14 
 
 		 652 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  23.23 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 281 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  28.98 
 
 		 671 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  39.29 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  28.41 
 
 		 671 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  32.41 
 
 		 652 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  21.66 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  29.41 
 
 		 671 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  24.22 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  34.94 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  29.45 
 
 		 339 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  24.17 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.67 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  26.57 
 
 		 664 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4638  hypothetical protein  22.29 
 
 		 342 aa  45.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 		 349 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  30.86 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  25.61 
 
 		 348 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  35 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0862  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00262563  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  25.87 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 		 354 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4519  dsba oxidoreductase  37.04 
 
 		 59 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.97 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  28.08 
 
 		 307 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  25.61 
 
 		 349 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  24.1 
 
 		 390 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  26.04 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  28.42 
 
 		 211 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  22.09 
 
 		 254 aa  42.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  23.61 
 
 		 232 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  23.95 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  26.51 
 
 		 275 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>