73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4638 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4638  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  709    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  25.66 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  20.12 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  21.62 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  21.1 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  21.41 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  21.82 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 		 240 aa  55.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  25.33 
 
 		 246 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  27.59 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  26.71 
 
 		 671 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  26.71 
 
 		 671 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 		 664 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 		 219 aa  52.8  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  23.32 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  26.29 
 
 		 624 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  23.67 
 
 		 245 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  24.39 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  22.16 
 
 		 232 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  27.08 
 
 		 242 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  25.33 
 
 		 265 aa  50.4  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  25.17 
 
 		 671 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  25.51 
 
 		 652 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  28.48 
 
 		 600 aa  49.7  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  26.19 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  25.17 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  25.95 
 
 		 876 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 172 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  22.3 
 
 		 182 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 173 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  25.17 
 
 		 179 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  21.82 
 
 		 254 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  26.62 
 
 		 268 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  24.5 
 
 		 221 aa  47.4  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  21.76 
 
 		 238 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  20.83 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  25 
 
 		 616 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  24.24 
 
 		 247 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  25.17 
 
 		 173 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  25.17 
 
 		 219 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  24.36 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  22.29 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  23.81 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  27.56 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  24.36 
 
 		 231 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  24.67 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  25 
 
 		 207 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  28.08 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  17.39 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  23.33 
 
 		 182 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  27.45 
 
 		 652 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  25 
 
 		 553 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2375  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  25.69 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  24.82 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  24.07 
 
 		 248 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  28.08 
 
 		 247 aa  43.9  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  23.16 
 
 		 275 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3226  Na+/H+ antiporter NhaA  24.24 
 
 		 627 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  23.39 
 
 		 246 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  24.22 
 
 		 207 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  24.22 
 
 		 207 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  22.73 
 
 		 281 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  24.22 
 
 		 207 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  24.22 
 
 		 207 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  24.22 
 
 		 207 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  21.13 
 
 		 236 aa  42.7  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  20.59 
 
 		 254 aa  42.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>