88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1397 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  529  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  77.78 
 
 		 254 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  84.67 
 
 		 254 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  80.84 
 
 		 254 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  84.67 
 
 		 254 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  76.98 
 
 		 245 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  51.56 
 
 		 247 aa  254  7e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0947  hypothetical protein  52.53 
 
 		 247 aa  249  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  59.69 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  51.64 
 
 		 247 aa  241  6e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2185  hypothetical protein  52.16 
 
 		 247 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  54.07 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1768  protein-disulfide isomerase-like protein  43.5 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00864718  hitchhiker  0.000943846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  46.83 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  45.97 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4096  hypothetical protein  41.25 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0857  hypothetical protein  47.78 
 
 		 234 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.473961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36300  DSBA oxidoreductase  46.15 
 
 		 241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  42.6 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  41.57 
 
 		 217 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  35.03 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.58 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  31.74 
 
 		 276 aa  89.4  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  27.35 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  31.91 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  24.58 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  26.14 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  31.93 
 
 		 172 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  26.73 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4638  hypothetical protein  23.32 
 
 		 342 aa  52  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 182 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  25.53 
 
 		 335 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  30.53 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  40 
 
 		 671 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  35.34 
 
 		 671 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  35.34 
 
 		 671 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  21.97 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  27.07 
 
 		 281 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  24.87 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  29.41 
 
 		 617 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  24.29 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  19 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  30.49 
 
 		 652 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  28.38 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  27.78 
 
 		 652 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  25.42 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 		 339 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  20.43 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  26.35 
 
 		 179 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  22.99 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1535  hypothetical protein  30.22 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.480424  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 218 aa  45.8  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  28.38 
 
 		 210 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  28.77 
 
 		 210 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  28.39 
 
 		 307 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  28.24 
 
 		 613 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  31.65 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  24.11 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  28.24 
 
 		 613 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  28.77 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  28.24 
 
 		 613 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  31.76 
 
 		 664 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  25.66 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  24.03 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4519  dsba oxidoreductase  40 
 
 		 59 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  26.7 
 
 		 617 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 		 204 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  27.52 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  31.85 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 311 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  29.63 
 
 		 624 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 241 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  25.22 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  23.03 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 311 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  24.5 
 
 		 220 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  29.01 
 
 		 398 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36550  hypothetical protein  37.88 
 
 		 89 aa  42  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  22.54 
 
 		 231 aa  42  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  27.37 
 
 		 275 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 265 aa  42  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  26.38 
 
 		 228 aa  42  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  35 
 
 		 260 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>