89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4180 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  78.37 
 
 		 254 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  76.98 
 
 		 261 aa  364  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  77.14 
 
 		 254 aa  355  2.9999999999999997e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  77.55 
 
 		 254 aa  354  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  80.84 
 
 		 254 aa  346  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  54.32 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  61.9 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0947  hypothetical protein  55.98 
 
 		 247 aa  248  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2185  hypothetical protein  55.32 
 
 		 247 aa  234  7e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  52.38 
 
 		 236 aa  205  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1768  protein-disulfide isomerase-like protein  44.44 
 
 		 225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00864718  hitchhiker  0.000943846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  49.3 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4096  hypothetical protein  41.56 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  41.44 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0857  hypothetical protein  47.49 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.473961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36300  DSBA oxidoreductase  46.33 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  42.6 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  42.77 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.92 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  36.53 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  31.1 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  34.21 
 
 		 335 aa  65.5  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  26.4 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  32.17 
 
 		 664 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  24.42 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 		 335 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  24.02 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 339 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  33.56 
 
 		 671 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  33.56 
 
 		 671 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 182 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  23.6 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4638  hypothetical protein  23.67 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  31.08 
 
 		 311 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  38.05 
 
 		 671 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  28.42 
 
 		 262 aa  48.5  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  29.03 
 
 		 260 aa  48.5  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  26.95 
 
 		 238 aa  48.5  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  26.06 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  26.8 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  24.5 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  27.74 
 
 		 652 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  26.38 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  25.85 
 
 		 349 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  30.57 
 
 		 652 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 		 179 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.81 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  33.33 
 
 		 398 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  25.53 
 
 		 348 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  26.06 
 
 		 354 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.33 
 
 		 244 aa  45.4  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  28.44 
 
 		 876 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  23.78 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  24.08 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36550  hypothetical protein  39.56 
 
 		 89 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  25.53 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  27.7 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 311 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  24.68 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 311 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  25.17 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  28.19 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  29.87 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  29.5 
 
 		 390 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  27.42 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 		 182 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  30.37 
 
 		 624 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  35 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  22.89 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.86 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 229 aa  42.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  24.38 
 
 		 232 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  36.96 
 
 		 211 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1535  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.480424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  32.35 
 
 		 284 aa  42  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000197952  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4519  dsba oxidoreductase  37.04 
 
 		 59 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  27.12 
 
 		 253 aa  42  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  25.68 
 
 		 241 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>