42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1768 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1768  protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 		 225 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00864718  hitchhiker  0.000943846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4096  hypothetical protein  92.44 
 
 		 244 aa  430  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  50.5 
 
 		 254 aa  204  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  51 
 
 		 254 aa  204  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  50.5 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  50.51 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  48.02 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  44.1 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  46.89 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  49.73 
 
 		 248 aa  187  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  47.18 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  47.62 
 
 		 236 aa  175  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0947  hypothetical protein  48.21 
 
 		 247 aa  175  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2185  hypothetical protein  47.69 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36300  DSBA oxidoreductase  42.61 
 
 		 241 aa  141  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0857  hypothetical protein  42.77 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.473961  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  42.16 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  42.11 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  39.88 
 
 		 217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  38.37 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.77 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  31.76 
 
 		 257 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  26.37 
 
 		 276 aa  71.6  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  22.67 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  40.74 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  20.57 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  22.54 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  26.51 
 
 		 268 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 664 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 671 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 671 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0862  DSBA oxidoreductase  25.84 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00262563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  23.29 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  25 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  38.6 
 
 		 671 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  20.81 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  23.12 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  27.63 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  36.36 
 
 		 652 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>