49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4096 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4096  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1768  protein-disulfide isomerase-like protein  92.44 
 
 		 225 aa  430  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00864718  hitchhiker  0.000943846 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  47 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  47.5 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  47.52 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  44.55 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  46.97 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  38.4 
 
 		 254 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  43.54 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  45.99 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  44.1 
 
 		 247 aa  168  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0947  hypothetical protein  44.62 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  44.31 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2185  hypothetical protein  44.1 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36300  DSBA oxidoreductase  41.48 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0857  hypothetical protein  41.04 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.473961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  40.35 
 
 		 228 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  38.92 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  39.77 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  38.95 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.12 
 
 		 286 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 		 257 aa  91.7  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  25.82 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  24 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  23.81 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  42.59 
 
 		 172 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  20.11 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  27.71 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 664 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  23.5 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  22.02 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  26.17 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  27.64 
 
 		 218 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  28.05 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  26.37 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 671 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 671 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  25.34 
 
 		 224 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  26.42 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  38 
 
 		 671 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  38.18 
 
 		 652 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0862  DSBA oxidoreductase  21.79 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00262563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  22.82 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  23.64 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  22.28 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  22.95 
 
 		 284 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>